Diferența cheie între protiu și deuteriu este că protiul nu are neutroni în nucleul său atomic, în timp ce deuteriul are un neutron.
Protiul și deuteriul sunt izotopi ai hidrogenului. Prin urmare, ele diferă între ele în funcție de numărul de neutroni prezenți în nucleii lor atomici. Hidrogenul conține un proton în nucleul atomic: astfel, numărul atomic al hidrogenului este 1. Există trei izotopi ai hidrogenului. Toți cei trei izotopi conțin, de asemenea, un proton. Putem denota cei trei izotopi ca 1 H, 2 H și 3 H. Valorile din supercript sunt masele atomice ale acestor elemente.