Diferența esențială dintre sintenie și colinearitate este că sintenia este co-localizarea fizică a loci genetici pe același cromozom la specie, în timp ce colinearitatea este co-localizarea fizică a loci genetici pe același cromozom la diferite specii care păstrează aceeași ordine.
Sinteza și colinearitatea sunt doi termeni care sunt folosiți în mod alternativ în genomică. Ambii termeni descriu tiparele de localizare a genelor pe cromozomi la diferite specii. Aceste aranjamente genetice înrudite între taxoni sunt informații valoroase atunci când se deduce descendența comună a genelor. Sinteza se referă la co-localizarea fizică a locurilor genetice pe același cromozom la specii. Colinearitatea se referă la co-localizarea fizică a locurilor genetice pe același cromozom la diferite specii care păstrează aceeași ordine. Prin urmare, este o formă de sinteză.
