Diferența cheie între jejun și ileon este că jejunul este partea mijlocie a intestinului subțire care se află între duoden și ileon, în timp ce ileonul este partea finală a intestinului subțire care se află între jejun și cec.
Intestinul subțire este format din trei părți: duoden, jejun și ileon. Duodenul este prima parte, urmată de jejun și ileon. Jejunul și ileonul se află în mijlocul cavității abdominale încadrate de intestinul gros. Nu există o linie naturală de separare care să distingă jejunul și ileonul. Cu toate acestea, există o diferență subtilă între jejun și ileon. Atât jejunul, cât și ileonul au o suprafață interioară ușor alcalină sau neutră și sunt importante în absorbția nutrienților din produsele digerate. Aceste două porțiuni împreună au o lungime de aproximativ 6,5 m, ileonul cuprinzând trei cincimi, în timp ce jejunul cuprinzând restul (două cincimi). Mai mult, ambele porțiuni conțin mezentere, care inițiază mobilitatea intestinului; prin urmare, ajută la deplasarea alimentelor de-a lungul tractului intestinal printr-un proces numit peristaltism.