Diferența cheie - Transpozaze bacteriene față de Integraze retrovirale
Materialul genetic transportabil a evoluat cu două strategii majore pentru a trece de la o regiune la următoarea regiune din interiorul și între genomi. O metodă este deplasarea printr-o moleculă de ARN înainte de formarea unei molecule de ADN, în timp ce cealaltă cale implică intermediari ADN. Transpozazele și integrazele virale sunt exemple de astfel de materiale genetice transpozabile. Transpozazele bacteriene se leagă de capătul transpozonilor și facilitează cataliza mișcării transpozonului către o altă parte a genomului prin diferite mecanisme. Integrazele retrovirale sunt enzime care ajută la integrarea materialului genetic al retrovirusului, cum ar fi HIV, în materialul genetic (ADN) al celulei gazdă pe care o infectează. Aceasta este diferența cheie între transpozazele bacteriene și integrazele retrovirale.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferența cheie
2. Ce sunt transpozazele bacteriene
3. Ce sunt integrazele retrovirale
4. Asemănări între transpozazele bacteriene și integrazele retrovirale
5. Compararea alăturată - Transpozările bacteriene vs Integrazele retrovirale în formă tabelară
6. Rezumat
Ce sunt transpozazele bacteriene?
Transpozaza poate fi definită ca o enzimă legată de capătul transpozonilor care facilitează cataliza mișcării transpozonului către o altă parte a genomului prin diferite mecanisme. Astfel de mecanisme includ „mecanismul de tăiere și lipire” și „mecanismul de transpunere replicativă”. Transpozaza a fost introdusă mai întâi prin clonarea enzimei care este necesară pentru transpunerea transpozonului Tn3. Două strategii importante au fost utilizate de elementele genetice transpozabile pentru deplasarea dintre genomi sau de la un sit la altul. Transportul printr-un intermediar de ARN înainte de sinteza unei copii ADN este o strategie în timp ce cealaltă este legată numai de intermediarii ADN. Reacțiile de recombinare care sunt implicate în integrarea ambelor elemente au loc datorită enzimelor specifice elementului. Prin urmare,într-o instanță de elemente ADN, aceste enzime sunt cunoscute sub numele de transpozaze, în timp ce într-o instanță de elemente ARN, sunt cunoscute ca integraze.
Când se compară diferențele dintre ambele strategii de transpunere, procesul de inserție pare a fi identic din punct de vedere chimic. Dar, dovezi recente propun că anumite asemănări în mecanismul de integrare sunt observate în regiunile secvențelor de aminoacizi care formează un sit activ; motivul DDE. Cinci familii de transpozaze sunt clasificate în prezent, dar numărul familiilor este încă în creștere odată cu noile caractere de transpozază. Familiile includ transpozază DDE, transpozază tirozină (Y), transpozază serină (S), transpozază în cerc rulant, transcriptaze revers / endonucleaze (RT / En) etc. Aceste familii utilizează mecanisme catalitice unice pentru ruperea și reîncadrarea ADN-ului. Transpozaza DDE implică mecanismul de tăiere și lipire a transpozonului original și poartă trei seturi de aminoacizi conservați și anume;aspartat (D), aspartat (D) și glutamat (E). Transpozazele de tirozină implică, de asemenea, în mecanismul de tăiere și lipire prin utilizarea reziduurilor de tirozină, care este specifică site-ului.
Figura 01: Transpozaze bacteriene
Serinele transpozaze implică un intermediar de ADN circular și realizează mecanismul de tăiere și lipire la fel ca deasupra familiilor. Transpozaza cercului rulant implică mecanismul de copiere în care o singură catenă este copiată direct în situsul țintă prin replicarea ADN-ului. Acest lucru asigură faptul că firul șablon și firul copiat au un fir nou sintetizat. Transcriptazele inverse / endonucleaze transpozaza are diverse mecanisme de transpunere.
Ce sunt integrazele retrovirale?
În contextul Retroviral Integrase, este considerată o enzimă retrovirală care ajută la integrarea materialului genetic al retrovirusului, cum ar fi HIV, în materialul genetic (ADN) al celulei infectate. Aceste integraze retrovirale se confundă cel mai adesea cu integrazele fagice. Exemple pentru integraze fagice sunt integrarea fagului λ. Dar acestea sunt enzime complet diferite și nu trebuie confundate cu. În ceea ce privește formarea complexului de pre-integrare retroviral, integraza retrovirală joacă un rol major. Proteinele integrazei retrovirale constau de obicei din trei (03) domenii canonice. Aceste domenii sunt conectate prin linkeri flexibili.
Cele trei domenii includ un domeniu N-obligatoriu de legare a zincului în care trei fascicule elicoidale sunt conectate și stabilizate prin coordonare cu implicarea unui Zn 2+cation, un domeniu de bază catalitic RNase H fold și un domeniu de legare a ADN-ului C terminal, care este un SH3 fold. Prin investigație și prin informații biochimice și structurale, se sugerează că integraza retrovirală are capacitatea de a funcționa ca un dimer de variatoare (tetramer). În contextul multimerizării și al legării ADN-ului viral, toate cele trei domenii ale proteinei retrovirale integrase. Funcția majoră a integrazei retrovirale este de a insera materialul său genetic pentru a găzdui ADN. Acest pas este cel mai crucial pas în replicarea virală a virusului HIV. Odată integrat cu succes, va fi acolo în ADN-ul cromozomial al celulei pentru tot restul vieții sale.
Figura 02: Integraze retrovirale
Prin urmare, odată integrată nu există nicio revenire pentru celulă. Aceste integraze retrovirale implică catalizarea a două reacții majore, incluzând procesarea finală 3 'și ligatura covalentă. În timpul procesării capătului 3 ', 2-3 nucleotide de la ambele capete 3' ale ADN-ului viral sunt îndepărtate cu intenția de a dezvălui dinucleotidele CA ale capetelor 3 'ale ADN-ului viral și, în timpul ligaturii covalente, capetele 3' procesate ale ADN-ul viral este ligat covalent în ADN-ul cromozomial gazdă.
Care este asemănarea dintre transpozazele bacteriene și integrazele retrovirale?
Atât transpozazele bacteriene, cât și integrazele retrovirale au secvențe de aminoacizi similare
Care este diferența dintre transpozazele bacteriene și integrazele retrovirale?
Difuzarea articolului din mijloc înainte de tabel
Transpozaze bacteriene față de Integraze retrovirale |
|
| Transpozaza bacteriană este o enzimă legată de capătul transpozonilor, facilitând în același timp cataliza mișcării transpozonului către o altă parte a genomului prin diferite mecanisme. | Retroviral Integrases este considerat ca o enzimă retrovirală care ajută la integrarea materialului genetic al retrovirusului, cum ar fi HIV, în materialul genetic (ADN) al celulei infectate. |
| Regiuni obligatorii | |
| Sunt necesare regiuni de legare specifice ridicate pentru transpozazele bacteriene. | Pentru legare este necesară o secvență de nucleotide mai mică sau deloc. |
Rezumat - Transpozaze bacteriene vs Integraze retrovirale
Transpozazele bacteriene sunt considerate ca o enzimă retrovirală care ajută la integrarea materialului genetic al retrovirusului precum HIV în materialul genetic (ADN) al celulei infectate. Două strategii importante au fost utilizate de elementele genetice transpozabile pentru deplasarea dintre genomi sau de la un sit la altul. Cinci familii de transpozaze sunt clasificate în prezent, dar numărul familiilor este încă în creștere odată cu noile caractere de transpozază. Retroviral Integrase, este considerat ca o enzimă retrovirală care ajută la integrarea materialului genetic al retrovirusului precum HIV în materialul genetic (ADN) al celulei infectate. Proteinele integrazei retrovirale constau de obicei din trei (03) domenii canonice. Funcția majoră a integrazei retrovirale este de a insera materialul său genetic pentru a găzdui ADN. Acest pas este cel mai crucial pas în replicarea virală a virusului HIV. Prin urmare, odată integrată nu există nicio revenire pentru celulă. Aceasta este diferența dintre transpozazele bacteriene și integraza retrovirală.
Descărcați PDF-ul Transpozelor bacteriene față de Integrazele retrovirale
Puteți descărca versiunea PDF a acestui articol și o puteți folosi în scopuri offline conform notei de citare. Vă rugăm să descărcați versiunea PDF aici: Diferența dintre transpozazele bacteriene și integrazele retrovirale
