Diferența cheie - VNTR vs STR
Studiile ADN au o utilitate imensă în înțelegerea și determinarea relațiilor filogenetice, diagnosticarea bolilor genetice și cartografierea genomului organismului. Mai multe tehnici asociate cu analiza ADN sunt utilizate pentru identificarea unei anumite gene sau a unei secvențe de ADN într-un grup de ADN necunoscut. Sunt cunoscuți ca markeri genetici. Markerii genetici sunt utilizați în biologia moleculară pentru a identifica variația genetică între indivizi și specii. Repetarea în tandem cu număr variabil (VNTR) și repetarea în tandem scurt (STR) sunt două tipuri de markeri genetici care prezintă polimorfism în rândul indivizilor. Ambele tipuri sunt ADN-uri repetitive necodificate care sunt repetări în tandem. Acestea sunt aranjate în mod cap la coadă în cromozomi. VNTR este o secțiune a genomului în care secvența scurtă de nucleotide se repetă de mai multe ori. STR este o altă secțiune a ADN-ului din genom, care este organizată ca unități repetate constând din două până la treisprezece nucleotide în sute de ori. Diferența cheie între VNTR și STR este numărul de nucleotide dintr-o secvență repetată. Unitățile repetate ale VNTR sunt formate din 10 până la 100 nucleotide, în timp ce unitatea repetată a STR constă din 2 până la 13 nucleotide. VNTR și STR sunt utilizate pe scară largă în studiile criminalistice.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferența cheie
2. Ce este VNTR
3. Ce este STR
4. Asemănări între VNTR și STR
5. Comparație side by side - VNTR vs STR în formă tabelară
6. Rezumat
Ce este VNTR?
O repetare în tandem este o scurtă secvență de ADN care se repetă în mod cap la coadă la un locus cromozomial specific. Nu există altă secvență sau nucleotidă în repetarea tandemului. Există mai multe tipuri de repetări tandem în genom. VNTR este un tip de repetare în tandem între ele care are unități repetate constând din 10 până la 100 nucleotide. VNTR este un tip de minisatelit. Aceste repetări în tandem pot fi găsite în mulți cromozomi. Acestea sunt intercalate în genomul uman și sunt situate predominant în regiunile subtelomerice ale cromozomilor.
VNTR-urile prezintă polimorfism de repetare în tandem în rândul indivizilor. Lungimea VNTR într-o anumită locație a cromozomului este foarte variabilă la indivizi datorită variației numărului de unități repetate organizate în acea secțiune ADN. Prin urmare, VNTR poate fi folosit ca un instrument puternic în identificarea indivizilor, iar analiza VNTR este utilizată în multe domenii, inclusiv genetică, cercetare biologică, criminalistică și amprentare ADN. VNTRs au fost primii markeri genetici utilizați pentru a cuantifica greutatea transplantului de măduvă osoasă. VNTR-urile au fost, de asemenea, primii markeri polimorfi utilizați în profilarea ADN în criminalistică.
Figura 01: Variația VNTR la șase persoane
Analiza VNTR se realizează prin polimorfism de lungime a fragmentului de restricție urmat de hibridizare sudică. Prin urmare, are nevoie comparativ de o probă mare de ADN. Interpretarea profilului VNTR este, de asemenea, problematică. Datorită acestor limitări, utilizarea VNTR în genetică criminalistică a fost limitată și este înlocuită cu analiza STR.
Ce este STR?
STR este o secțiune de ADN extrem de repetitivă, care constă din două până la treisprezece unități de repetare a nucleotidelor organizate în mod tandem. STR este similar cu VNTR. Dar variază de la VNTR de la numărul de nucleotide dintr-o secvență repetată și de numărul de repetări. STR este un tip de microsatelit.
Analiza STR implicată în măsurarea numărului exact de unități repetate. STR-urile sunt foarte variabile în rândul indivizilor, similar cu VNT-urile. Profilurile STR diferă de la persoană la persoană. Prin urmare, analiza STR este utilizată în biologia moleculară pentru a compara loci specifici pe ADN din două sau mai multe probe. Prin urmare, STR sunt considerați ca markeri genetici puternici în biologia moleculară. Oferă un instrument excelent pentru identificarea indivizilor datorită gradului ridicat de polimorfism și a lungimii relativ scurte.
În prezent, STR sunt cel mai frecvent utilizat instrument de polimorfism genetic analizat în genetică criminalistică. Cele mai multe cazuri de criminalistică implică analiza polimorfă STR. Locii STR sunt răspândiți în genom. Există mii de STR localizate în cromozomi care pot fi folosiți în analiza criminalistică. Analiza STR nu implică polimorfism de lungime de restricție precum analiza VNTR. Analiza STR nu reduce ADN-ul cu enzime de restricție. Sonde specifice sunt utilizate pentru a atașa regiunile dorite pe ADN și folosind tehnica PCR, se determină lungimile STR.
Figura 02: Variația STR între probe
Care sunt asemănările dintre VNTR și STR?
- VNTR și STR sunt ADN necodificat.
- Ambele sunt repetări în tandem.
- Ambele prezintă polimorfism în rândul indivizilor datorită diferenței de lungime a secțiunii ADN.
- Ambii sunt folosiți ca markeri genetici puternici în amprentarea ADN-ului și în studiile criminalistice.
Care este diferența dintre VNTR și STR?
Difuzarea articolului din mijloc înainte de tabel
VNTR vs STR |
|
| VNTR este un ADN repetitiv necodificat care are o scurtă secvență nucleotidică repetată într-un mod tandem. | STR este o secțiune de ADN extrem de repetitivă, care constă din două până la treisprezece unități de repetare a nucleotidelor organizate în mod tandem. |
| mărimea | |
| VNTR-urile sunt mai mari decât STR-urile. | STR-urile sunt mai mici decât VNTR-urile. |
| Numărul de nucleotide în secvența repetată | |
| Unitatea de repetare a VNTR constă din 10 până la 100 nucleotide. | Unitatea de repetare a STR constă din 2 până la 13 nucleotide. |
Rezumat - VNTR vs STR
VNTR și STR sunt doi markeri genetici puternici utilizați în biologia moleculară, în special în domeniul geneticii criminalistice. VNTR este un tip de minisatelit și STR este un microsatelit. VNTR și STR sunt ADN necodificat, foarte repetitiv. Sunt repetări în tandem. Structura generală a VNTR și STR este aceeași. Cu toate acestea, numărul de nucleotide din secvența repetată și lungimea sunt diferite. VNTR are secvențe repetate constând din 10 până la 100 nucleotide. STR are secvențe repetate constând din 2 până la 13 nucleotide. Aceasta este diferența dintre VNTR și STR.
Descărcați versiunea PDF a VNTR vs STR
Puteți descărca versiunea PDF a acestui articol și o puteți folosi în scopuri offline conform notelor de citare. Vă rugăm să descărcați versiunea PDF aici Diferența dintre VNTR și STR.
