Diferența cheie - Genotiparea vs secvențierea
Genotiparea și secvențierea sunt două tehnici efectuate pentru a obține informații despre acizii nucleici, în principal ADN-ul unui organism. Diferența cheie între genotipare și secvențiere este că genotiparea este procesul de determinare a variantei genetice pe care individul o posedă folosind markeri, în timp ce secvențierea este determinarea ordinii corecte a secvenței de nucleotide din fragmentul dat de ADN.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferența cheie
2. Ce este genotiparea
3. Ce este secvențierea
4. Comparație side by side - Genotiparea vs secvențierea
5. Rezumat
Ce este genotiparea?
Genotiparea este determinarea structurii genetice a unui individ utilizând o secvență de ADN și markeri și compararea și identificarea moștenirii sale. Genotiparea este importantă în biologia evoluției, biologia populației, taxonomia, ecologia și genetica organismelor. Poate fi realizat prin diferite tehnici, inclusiv secvențierea ADN, reacția în lanț a polimerazei, polimorfismul de lungime a fragmentului de restricție (RFLP), detectarea polimorfă amplificată aleatoriu, polimorfismul cu lungimea fragmentului amplificat (AFLP), microarrays de ADN etc.
Genotiparea implică secvențierea anumitor fragmente mici de secvențe de ADN și constatarea legăturii dintre compoziția genetică și alte persoane folosind markeri genetici. Determină polimorfismele nucleotidice unice (SNP) dintre indivizi sau alelele specifice. Genotiparea este aplicabilă unei game largi de organisme, inclusiv oamenilor. Este, de asemenea, aplicabil microorganismelor precum virusuri, ciuperci etc. și poate fi utilizat pentru a determina variantele lor genetice cu profilurile de referință. În epidemiologia moleculară și microbiologia criminalistică, controlul agenților patogeni, în special al microorganismelor, se face prin informațiile obținute din genotipare. Genotiparea este foarte importantă în analiza genealogică. Oamenii sunt genotipați pentru a confirma maternitatea și paternitatea. Genotipul va dezvălui alelele dominante și recesive ale genelor care decid trăsături specifice.
Figura_1: Genotipare RFLP
Ce este secvențierea?
Secvențierea este procesul de determinare a ordinii corecte a nucleotidei într-un anumit fragment de ADN sau ARN. Practic toate informațiile necesare pentru creșterea și dezvoltarea unui organism sunt codificate în genomul său. Disponibilitatea tehnicilor pentru a produce și a separa câteva sute de nucleotide fragmente de acizi nucleici lungi a dus la dezvoltarea unor proceduri de determinare a secvenței de nucleotide exacte a unui fragment dat de ADN sau ARN. Diferite tipuri de metode de secvențiere sunt disponibile astăzi. Aceste metode de secvențiere, împreună cu tehnologiile de construire a bibliotecilor de genom care reprezintă întregul genom al unui organism, facilitează secvențierea întregului genom al acelui organism, făcând o analiză aprofundată a structurilor genetice, a funcțiilor genetice, a localizărilor genelor, a expresiilor genetice, cartografierea genelor, regiunile de reglare a genelor etc.
Genomul total al multor virusuri, mai multe bacterii, arheobacterii, drojdii și alte câteva organisme au fost secvențiate și cartografiate. Proiectul genomului uman a făcut posibilă secvențierea și cartografierea întregului genom uman și publicarea primului proiect în 2003. Este o etapă majoră în progresul biologiei. Secvențele genomului uman sunt acum utilizate în sectorul medical pentru a identifica cauzele genetice ale bolilor rare, a examina riscul bolilor la nou-născuți, a identifica detaliile genetice ale diferitelor tipuri de cancer, a dezvolta noi terapii și a dezvolta noi instrumente de diagnostic etc.
În lumea plantelor, genomul orezului și genomul Arabidopsis au fost secvențiate. Cunoașterea acestor secvențe va revoluționa fără îndoială înțelegerea noastră despre modul în care funcționează celulele și organismele.
Figura_2: O autoradiografie a secvențierii sanger
Care este diferența dintre genotipare și secvențiere?
Difuzarea articolului din mijloc înainte de tabel
Genotipare vs secvențiere |
|
| Genotiparea este procesul de determinare a compoziției genetice a unui individ și de verificare a grupului sau a taxonomiei acelui organism. | Secvențierea este procesul de determinare a ordinii precise a nucleotidelor unui anumit fragment de ADN sau ARN. |
| Tehnici | |
| RFLP, secvențierea genelor, PCR, microarrays ADN, AFLP etc. | Secvențierea Sanger, secvențierea Gilbert, secvențierea piroza, secvențierea următoarei generații, secvențierea pușcă etc. |
| Preocupări majore | |
| Acest lucru este mai îngrijorat dacă diferențele de genotip dau diferențele reale de fenotip. | Acest lucru este mai preocupat de ordinea nucleotidelor și de diferențele și modificările sale cu alte organisme. |
Rezumat - Genotipare vs Secvențiere
Genotiparea și secvențierea sunt utile pentru studierea informațiilor genetice ale organismelor. Genotiparea este procesul de determinare a variațiilor de genotip în rândul indivizilor și de găsire a categoriilor acestora. Secvențierea este procesul de determinare a ordinii corecte a nucleotidelor din fragmentul interesat sau din regiunea ADN-ului. Ambele tehnici oferă informații importante despre gene și genomi.
