Diferența esențială între transpozonii compuși și cei non-compuși este că transpozonii compuși au două secvențe de inserție flancante, în timp ce transpozonii necompostiți au repetări inversate în loc de secvențe de inserție flancante.
Un transposon este un fragment de ADN care se poate transloca în interiorul genomului bacterian. Sunt secvențe mobile de ADN. Se mută în noi locații ale genomului. Aceste mișcări fac modificări în secvența genomului bacterian, provocând modificări semnificative în informațiile genetice. Ele sunt elementele genetice transpozabile responsabile de stabilirea de noi secvențe genetice la bacterii. Transpozonii sunt, de asemenea, denumiți gene de sărituri, deoarece aceste secvențe de sărituri pot bloca transcrierea genelor și rearanja materialul genetic al bacteriei. Mai mult, acestea sunt responsabile de mișcarea rezistenței la medicamente, a genelor de rezistență la antibiotice între plasmide și cromozomi. Există două tipuri de transpozoni ca transpozoni compoziti și necompoziti.
