Diferența cheie dintre bariera hematoencefalică și bariera LCR este că bariera hematoencefalică este bariera care separă țesutul sanguin de țesutul cerebral, în timp ce bariera LCR este o barieră funcțională care separă țesutul sanguin și lichidul cefalorahidian.
Bariera hematoencefalică și bariera LCR din sânge sunt două bariere de protecție în creier. De asemenea, ele sunt importante în transportul moleculelor prin creier și țesuturile sanguine periferice. În plus, ambele bariere au joncțiuni strânse care facilitează transferul de compuși netoxici în creier.
