Diferența cheie între porine și acvaporine este că porinele sunt pori plini de apă și canale găsite în membranele bacteriilor și eucariotelor. Între timp, acvaporinele sunt proteine de membrană care formează canale selective pentru apă în celulele vii.
Diferite molecule intră și ies din celulă prin membrana plasmatică din organismele vii. Astfel, există diferite proteine de membrană în membrana plasmatică pentru a menține și regla moleculele care intră și ies din celule. Porinele și acvaporinele sunt două astfel de tipuri de proteine de membrană. Dintre acestea, porinele sunt pori umpluți cu apă care facilitează transportul moleculelor hidrofile pe membrană. Între timp, acvaporinele sunt canale selective pentru apă, care permit în mod specific apei să treacă liber prin membrană.