Diferența cheie între ribozime și enzime proteice este că ribozimele sunt molecule de ARN care sunt capabile să catalizeze anumite reacții biochimice specifice, în timp ce enzimele proteice sunt molecule de proteine care sunt capabile să catalizeze majoritatea reacțiilor biochimice care apar în organismele vii.
Enzimele sunt catalizatori biologici și accelerează viteza reacțiilor biochimice. În general, toate enzimele sunt proteine formate din aminoacizi. Prin urmare, acestea sunt denumite și enzime proteice. Cu toate acestea, există molecule de ARN specifice care pot acționa ca catalizatori ai reacțiilor biochimice specifice. Sunt ribozimele sau enzimele acidului ribonucleic. Prin urmare, atât ribozimele, cât și enzimele proteice îndeplinesc aceeași funcție care este catalizatorul reacțiilor biochimice.