Diferența cheie dintre boala Paget și eczemă este că boala Paget este o tulburare focală a remodelării osoase, iar eczema este o afecțiune inflamatorie a pielii caracterizată prin grupuri de leziuni veziculare cu un grad variabil de exudate și scalare.
Boala Paget apare din cauza mutațiilor din anumite gene, cum ar fi factorul nuclear kappa B, sequestozomul p62 și osteoprotegerina. Pe de altă parte, eczema apare ca urmare a reacțiilor de hipersensibilitate apărute împotriva diferiților alergeni. Această diferență în patogenie este principala diferență între cele două boli.