Diferența cheie - Gel de stivuire vs gel de separare
Termenii gel de stivuire și gel de separare sunt folosiți în explicarea tehnicii SDS-PAGE. SDS-PAGE sau electroforeza pe gel de dodecil sulfat de sodiu-poliacrilamidă este o tehnică de laborator care este utilizată pentru separarea moleculelor de proteine pe baza greutăților lor moleculare. Teoria din spatele tehnicii este că proteinele cu greutăți moleculare diferite prezintă rate de migrație diferite; moleculele cu greutate moleculară mică migrează mai repede în timp ce moleculele cu greutate moleculară mică migrează încet. Mediul pentru migrare este un gel. Există două tipuri de geluri denumite gel de stivuire și gel de separare. Diferența cheie între gelul de stivuire și gelul de separare este că pH-ul gelului de stivuire este de 6,8, în timp ce pH-ul gelului de separare este de 8,8.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferența cheie
2. Ce este gelul de stivuire
3. Ce este gelul de separare
4. Relația dintre gelul de stivuire și gelul de separare
5. Comparație side by side - Gel de stivuire vs gel de separare sub formă de tabel
6. Rezumat
Ce este gelul de stivuire?
Gelul de stivuire este un gel de poliacrilamidă concentrat scăzut, care este plasat pe partea superioară a gelului de rezolvare mai concentrat (gel de separare) în tehnica SDS-PAGE. Gelul de stivuire este utilizat pentru a îmbunătăți rezoluția electroforezei. Rezoluția crește din cauza diferenței dintre concentrațiile de gel de stivuire și gelul de rezolvare care au efect asupra proteinelor din probă. Deoarece concentrația de poliacrilamidă în gelul de stivuire este scăzută, dimensiunea porilor este mai mare. Acest lucru ajută și la creșterea separării.
Gelul de stivuire este un gel liber de poliacrilamidă cu pori mari de aproximativ 7% poliacrilamidă. Acești pori nu acționează ca o barieră considerabilă pentru moleculele mari de proteine. Prin urmare, acest gel afectează ușor mobilitatea acestor proteine. Acest lucru face separarea în funcție de mobilitatea și dimensiunea proteinelor, concentrându-le între două geluri.
Figura 01: Gel de acrilamidă SDS-PAGE
PH-ul gelului de stivuire este de 6,8. PH-ul său este acid decât cel al rezolvării gelului cu 2 unități de pH. Acest pH implică o rezistență ionică mai mică, deci o rezistență electrică mai mare. Acest lucru provoacă mobilitatea proteinelor decât alte particule încărcate prezente în gel.
Ce este gelul separat?
Gelul de separare sau de rezolvare a unei tehnici SDS-PAGE este un gel de poliacrilamidă foarte concentrat, care este plasat pe partea superioară a gelului de stivuire concentrat. Gelul de separare conține o cantitate mare de poliacrilamidă (10%). PH-ul acestui gel este menținut ca pH = 8,8, care este un nivel de pH mai mare decât cel al gelului de stivuire.
Figura 02: Un aparat de electroforeză pe gel
Când moleculele proteice ajung la gelul de separare, migrația acestor molecule este încetinită, deoarece gelul de separare este un gel cu concentrație ridicată, cu o dimensiune mică a porilor, care poate acționa ca o barieră considerabilă pentru mișcarea moleculelor de proteine. Această încetinire permite celorlalte proteine să migreze încet pentru a ajunge din urmă, rezultând o bandă îngustă și concentrată între cele două geluri.
Care este relația dintre gelul de stivuire și gelul de separare?
Atât tipurile de gel de stivuire, cât și tipurile de gel de separare sunt utilizate în același aparat
Care este diferența dintre gelul de stivuire și gelul de separare?
Difuzarea articolului din mijloc înainte de tabel
Gel de stivuire vs gel de separare |
|
| Gelul de stivuire este un gel de poliacrilamidă cu un nivel scăzut de concentrare, care este plasat pe partea superioară a unui gel de rezolvare mai concentrat (gel de separare) în tehnica SDS-PAGE. | Gelul de separare sau de rezolvare a unei tehnici SDS-PAGE este un gel de poliacrilamidă foarte concentrat, care este plasat pe partea superioară a unui gel de stivuire concentrat. |
| Plasament | |
| Gelul de stivuire este plasat pe gelul de rezolvare (separare). | Gelul de separare este plasat pe fundul recipientului utilizat pentru electroforeza pe gel. |
| Concentraţie | |
| Concentrația gelului de stivuire este mare. | Concentrația gelului de separare este scăzută. |
| Conținut de poliacrilamidă | |
| Gelul de stivuire conține aproximativ 7% poliacrilamidă. | Gelul de separare conține aproximativ 10% poliacrilamidă. |
| pH | |
| PH-ul gelului de stivuire este de 6,8. | PH-ul gelului de separare este de 8,8. |
| Dimensiunea porilor | |
| Dimensiunile mari ale porilor sunt prezente în gelul de stivuire. | Dimensiunile mici ale porilor sunt prezente în gelul de separare. |
| Rezoluţie | |
| Gelul de stivuire oferă o rezoluție mai bună. | Gelul de separare oferă o rezoluție slabă. |
Rezumat - Gel de stivuire vs gel de separare
Gelul de stivuire și gelul de separare sunt două tipuri de geluri de poliacrilamidă utilizate pentru a obține o separare mai bună a moleculelor de proteine într-o probă dată. Diferența dintre gelul de stivuire și gelul de separare este că pH-ul gelului de stivuire este de 6,8, în timp ce pH-ul gelului de separare este de 8,8.
