Diferența esențială dintre centromer și cromer este că centromerul este o regiune restrânsă care unește cromatidele surori împreună într-un cromozom, în timp ce cromomerul este o structură asemănătoare mărgelei, aranjată liniar, prezentă pe lungimea cromozomului.
Un cromozom este o structură asemănătoare firului compusă din acizi nucleici și proteine. Acestea conțin informațiile genetice ale unui organism. Există mai multe regiuni distincte într-un cromozom, inclusiv cromatide, centromere, cromere și telomere. Centromerul este punctul vizibil de constricție din cromozom. Acesta unește cromatidele surori împreună și este important în timpul diviziunii celulare. În schimb, cromomerii sunt cromatină strâns înfășurată prezentă pe lungimea cromozomului. Ele apar ca mărgele pe un șir. Ei poartă gene în timpul moștenirii.