Diferența cheie între CRISPR și enzimele de restricție este că CRISPR este un mecanism de apărare imunitar procariotică natural, care a fost folosit recent pentru editarea și modificarea genelor eucariote, în timp ce enzimele de restricție sunt foarfece biologice care scindează moleculele ADN în substanțe mai mici.
Editarea genomului și modificarea genelor sunt domenii interesante și inovatoare în genetică și biologie moleculară. Studiile de terapie genică utilizează pe scară largă modificarea genelor. Mai mult, modificarea genei este utilă în identificarea proprietăților genei, funcționalității genei și modul în care mutațiile genei ar putea afecta funcția acesteia. Este important să se obțină modalități eficiente și fiabile de a face modificări precise, direcționate, la genomul celulelor vii. CRISPR și restricțiile enzimelor joacă roluri cheie în modificările genelor. CRISPR modifică genele cu precizie ridicată. Enzimele de restricție funcționează ca foarfece biologice care scindează moleculele ADN în substanțe mai mici.