Diferența esențială dintre testarea ADN-ului matern și patern se bazează pe tipul de sursă de ADN utilizat în procedura de testare. Testarea ADN-ului matern utilizează ADN-ul mitocondrial pentru a obține ascendența maternă, în timp ce testarea ADN-ului patern folosește ADN-Y pentru a obține ascendența paternă.
Determinarea ascendenței atât la bărbați, cât și la femei este importantă pentru a determina relațiile familiale. Mai mult, testele ADN materne și paterne determină, de asemenea, identitatea indivizilor. Unele dintre tehnicile moleculare utilizate în această analiză sunt amprentarea ADN-ului, analiza Short Tandem Repeats și Restriction Fragment length polymorphism (RFLP).