Diferența cheie între ADN-ul mitocondrial și ADN-ul cloroplast este că ADN-ul mitocondrial este prezent în mitocondriile celulelor eucariote, în timp ce ADN-ul cloroplast este prezent în interiorul cloroplastelor celulelor vegetale.
Mitocondriile și cloroplastele sunt două organite importante legate de membrană în celulele eucariote. Mitocondriile sunt puterile celulelor. Pe de altă parte, cloroplastele sunt locurile fotosintezei la plante. Se crede că atât mitocondriile cât și cloroplastele provin de la celule procariote la celule eucariote prin endosimbioză. Aceste două organite conțin ADN propriu. Deși acest ADN nu este un ADN nuclear al unei celule și nu este important pentru funcționarea celulei, este important pentru unele dintre propriile lor organule celulare.
