Diferența cheie între celulele stem embrionare și cele somatice este că celulele stem embrionare sunt celule pluripotente nediferențiate care au origine embrionară, în timp ce celulele stem somatice sunt celule multipotente nediferențiate care sunt de țesut și de organ.
Celulele stem sunt celule nediferențiate care sunt capabile să crească în țesuturi sau organe adevărate. În general, există două tipuri majore de celule stem, cum ar fi celulele stem embrionare și celulele stem adulte (celule stem somatice). În cazul diferențierii, celulele stem embrionare se pot diferenția în orice tip de celule. În schimb, celulele stem somatice se pot diferenția doar în mai multe celule specifice țesutului. Prin urmare, celulele stem embrionare sunt pluripotente, în timp ce celulele stem somatice sunt multipotente. În cuvinte simple, capacitatea de diferențiere este mare în celulele stem embrionare în comparație cu cea a celulelor stem somatice.