Diferența cheie între celulele stem pluripotente și cele induse de pluripotență este că celulele pluripotente sunt celule mamă nediferențiate (de la embrioni etc.), care au capacitatea naturală de a se diferenția în diferite tipuri de celule, în timp ce celulele stem pluripotente induse sunt celule somatice adulte care au au fost reprogramate genetic pentru a arăta caracteristici similare celulelor stem pluripotente naturale.
O celulă stem este o celulă nediferențiată care are capacitatea unică de a se dezvolta în celule diferite sau specializate. Mai mult, celulele stem sunt de trei tipuri și anume unipotente, pluripotente și multipotente. Dacă o celulă stem se poate diferenția într-una, mai multe și în toate tipurile de celule, este cunoscută sub numele de celule stem unipotente, multipotente sau pluripotente. Dintre cele trei tipuri de mai sus, celulele stem pluripotente sunt importante, deoarece se pot diferenția în toate tipurile de celule. O celulă stem embrionară pluripotentă se poate dezvolta într-o întreagă ființă umană.
