Diferența cheie între metafaza 1 și 2 este că în metafaza 1, cromozomii omologi se împerechează la placa metafazică în timp ce în metafaza 2, cromozomii singuri se aliniază la placa metafazică.
Meioza este procesul care transformă o celulă diploidă în patru celule haploide în timpul formării gametilor. Este un proces important, deoarece crește diversitatea genetică printre descendenți. Meioza este vitală în reproducerea sexuală datorită importanței sale în formarea celulelor haploide. Meioza apare prin două diviziuni nucleare succesive numite meioza I și meioza II. Fiecare divizie nucleară poate fi subdivizată din nou în profază, metafază, anafază și telofază. Prin urmare, metafaza este stadiul diviziunii celulare în care cromozomii se aranjează de-a lungul plăcii metafazice. Metafaza 1 poate fi găsită în meioza I, în timp ce metafaza 2 poate fi găsită în meioza II. Metafaza 1 și 2 sunt diferite între ele.