Diferența cheie între apomorfie și plesiomorfie este că apomorfia se referă la o caracteristică care este unică pentru o cladă și se găsește la toți descendenții acelei clade în timp ce plesiomorfia se referă la o caracteristică care este prezentă în cladă, dar poate să nu fie prezentă toți membrii cladei.
În filogenetică, cladistica este zona care clasifică organismele în clade sau grupuri pe baza caracteristicilor moștenite de strămoși. Este o formă foarte fiabilă de studiu care ajută la analiza relațiilor evolutive și filogenetice. Diferite terminologii pot fi folosite pentru a descrie caracteristicile fiecărei clade, cum ar fi apomorfie, plesiomorfie, autapomorfie, sinapomorfie și omoplasie etc. Printre acestea, apomorfie și plesiomorfie sunt termeni relativi. În aceste studii, software-ul computerizat este cu adevărat util pentru a studia caracteristicile și caracteristicile Apomorphy și Plesiomorphy.
