Diferența cheie între Cosmid și Fagemid este în funcție de tipul de secvențe pe care le conține. Un Cosmid conține un sit cos și o plasmidă. Prin urmare, este un vector hibrid în timp ce un fagemid este o plasmidă care conține o origine F1 a replicării fagului F1.
Cosmidele și fagemidele sunt utilizate în scopuri de clonare, în special pentru a clona fragmente mai mari de ADN. Acestea sunt utilizate pe scară largă în special în clonarea genelor responsabile de producerea diverselor proteine. Cosmidele și fagemidele sunt fie reproduse singure ca plasmide, fie sunt ambalate în particule virale și apoi sunt reproduse.
