Diferența cheie între primer și promotor este că primerul este o secvență ADN scurtă sintetizată comercial care este utilizată în PCR pentru amplificarea unei secvențe ADN țintă în timp ce promotorul este o secvență ADN specifică care asigură un site de legare inițial sigur pentru ARN polimeraza și factorii de transcripție în pentru a iniția transcrierea.
Primer și promotor sunt două tipuri de secvențe de ADN. Primerul este un mic fragment de ADN necesar pentru reacția în lanț a polimerazei (PCR). Are secvențe scurte de nucleotide complementare capătului flancant al catenei ADN. Există două tipuri de primeri și funcționează ca puncte de plecare pentru sinteza de noi catene de ADN. În schimb, un promotor este o secvență specifică de ADN localizată în amonte de locul de inițiere a transcripției unei gene. Acesta interacționează direct cu componentele mecanismului de transcripție, cum ar fi ARN polimeraza și factorii de transcripție, pentru a controla transcripția ADN-ului. Prin urmare, ARN polimeraza și alți factori de transcripție se leagă de secvența promotorului și inițiază transcrierea.
