Diferența cheie între gena holandrică și gena legată de sex este că gena holandrică este o formă de genă legată de sex situată pe cromozomul Y, în timp ce gena legată de sex este o genă situată pe cromozomii sexuali.
O pereche de cromozomi sexuali poate decide sexul oamenilor și al altor mamifere. Bărbații au cromozomi XY, în timp ce femelele au cromozomi XX. Cromozomii X și Y nu sunt omologi. De asemenea, nu poartă aceleași gene. Cromozomul Y este mai scurt și poartă un număr mic de gene în comparație cu cromozomul X. Genele de pe cromozomul X sunt cunoscute sub numele de gene X legate. În mod similar, genele localizate pe cromozomul Y sunt cunoscute sub numele de gene Y legate sau gene holandrice. Ambele gene legate de X și Y legate sunt cunoscute în mod obișnuit ca gene legate de sex.