Diferența cheie între gena epistatică și gena hipostatică este că gena epistatică este o genă care influențează exprimarea altei gene la un locus diferit, în timp ce gena hipostatică este gena care se supune interferenței genei epistatice.
Anumite gene depind de alte gene non-alelice pentru expresiile lor. Epistaza este o formă de interacțiune genetică în care o genă interferează sau maschează expresia altei gene situată într-un locus diferit. Prin urmare, este un fel de interacțiune genetică non-alelică. În această interacțiune genică specială, două gene interacționează și sunt gena epistatică și gena hipostatică. În consecință, gena care maschează expresia altei gene este cunoscută sub numele de genă epistatică, în timp ce gena a cărei expresie este afectată este cunoscută sub numele de genă hipostatică.
