Diferența cheie între ciuperci și paraziți este că ciupercile sunt un grup de organisme saprotrofe eucariote, inclusiv drojdii, mucegaiuri și ciuperci, în timp ce paraziții sunt un grup de organisme care trăiesc pe sau în interiorul altui organism, obținând substanțe nutritive.
Atât ciupercile, cât și paraziții provoacă diverse boli la om. Nu numai la om, dar paraziții provoacă boli și la alte animale și plante. Paraziții sunt organismele care prezintă un mod de viață numit parazitism. Parazitismul este unul dintre cele trei tipuri de relații simbiotice care există între două sau mai multe specii care trăiesc împreună. Anumite specii de ciuperci, unele insecte, protozoare și helminti sunt exemple de paraziți. În parazitare, paraziții trăiesc pe sau în interiorul unui alt organism numit gazdă; parazitul oferă beneficii doar parazitului, provocând în același timp boli gazdei sale. Mai mult, paraziții nu pot supraviețui fără gazdele lor.