Diferența esențială dintre oomicete și zigomicete este că oomicetele nu conțin chitină pe pereții celulari, ci conțin celuloză, beta glucani și aminoacizi hidroxiprolină, în timp ce zigomicetele conțin chitosan pe pereții celulari. O altă diferență între oomicete și zigomicete este că starea vegetativă a omicetelor este diploidă, în timp ce zigomicetele sunt haploide sau dikariotice.
Oomicetele și zigomicetele sunt organisme eucariote microscopice. Oomycetes seamănă cu ciuperci adevărate. Dar sunt mucegaiuri de apă. Zygomycetes este o clasă majoră de phylum Zygomycota care sunt adevărate ciuperci. Sunt ciuperci omniprezente, saprofite, de mediu.