Diferența cheie între endosimbioză și simbioză este că endosimbioza este o teorie care descrie modul în care mitocondriile și cloroplastele au intrat în celulele eucariote, în timp ce simbioza este o interacțiune pe termen lung existentă între două specii vii diferite.
Organismele dintr-un ecosistem interacționează între ele în moduri diferite. Simbioza este o interacțiune care există între două specii diferite care trăiesc împreună. Unele interacțiuni beneficiază ambele părți, în timp ce unele interacțiuni rămân neutre. Cu toate acestea, unele alte interacțiuni sunt dăunătoare pentru o parte, în special pentru organismul gazdă, în timp ce cealaltă parte primește beneficii pe cheltuiala gazdei. Putem vedea toate aceste tipuri de interacțiuni într-un ecosistem. Cu toate acestea, aceste tipuri de interacțiuni sunt vitale pentru stabilitatea unui ecosistem. Endosimbioza, pe de altă parte, este o teorie care explică originea celulei eucariote dintr-o celulă procariotă.
