Diferența cheie între BLAST și FastA este că BLAST este un instrument de aliniere de bază disponibil pe site-ul web al Centrului Național pentru Informații despre Biotehnologie, în timp ce FastA este un instrument de căutare a similarității disponibil pe site-ul Institutului European de Bioinformatică.
BLAST și FastA sunt două programe software care sunt utilizate pe scară largă pentru a compara secvențele biologice de ADN, aminoacizi, proteine și nucleotide din diferite specii și pentru a căuta similitudinile lor. Acești algoritmi au fost scrise ținând cont de viteză. Deoarece, atunci când oamenii de știință au reușit să izoleze ADN-ul în laborator la mijlocul anilor 1980, a crescut nevoia de a compara și de a găsi gene identice pentru cercetări ulterioare la viteză mare. Prin urmare, aceste două software-uri au fost dezvoltate într-un mod în care utilizatorul poate face o căutare rapidă a secvențelor similare cu cea a secvențelor lor de interogare.
BLAST este un acronim pentru Instrumentul de căutare a alinierii locale de bază și folosește abordarea localizată în compararea celor două secvențe. FastA este un software care se referă la Fast A, unde A înseamnă All. Aici, software-ul funcționează cu alfabete precum Fast A pentru secvențierea ADN și Fast P pentru proteine. Atât BLAST, cât și FastA sunt foarte rapide în compararea oricărei baze de date de genom și, prin urmare, sunt foarte viabile din punct de vedere monetar, precum și în economisirea timpului.
