Diferența cheie între bioreactor și fermentator este tipul de reacție biochimică care are loc în interiorul vaselor închise. Un bioreactor facilitează toate tipurile de reacții biochimice, dar un fermentator facilitează numai fermentarea.
Aplicarea biotehnologiei în industrie este un domeniu interesant al științei. Aceste aplicații variază de la aplicații microbiene la aplicația pe bază de animale. Mai mult, aplicațiile industriale ale biotehnologiei variază în domeniile principale, cum ar fi agricultura, medicina și diverse industrii. Bioreactoarele sunt vase închise în care sunt create condițiile necesare pentru a facilita diferite tipuri de reacții biochimice. Fermentatorii aparțin grupului de bioreactoare, dar este în special pentru a efectua doar fermentația.