Diferența cheie între izopentan și neopentan este că izopentanul conține un lanț de carbon cu patru membri cu o grupare metil atașată la acest lanț la al doilea atom de carbon al lanțului, în timp ce neopentanul conține un centru de carbon atașat cu patru grupări metil.
Isopentanul și neopentanul sunt izomeri structurali unul de celălalt. Prin urmare, ambii acești compuși au aceeași formulă chimică; C 5 H 12. Cu toate acestea, datorită diferenței dintre izopentan și neopentan în structurile lor chimice, acestea au proprietăți chimice și fizice diferite. O altă diferență notabilă între izopentan și neopentan este că izopentanul există sub formă de lichid incolor, în timp ce neopentanul este un gaz incolor la temperatura și presiunea standard.