Diferența cheie între genetica clasică și cea modernă este că genetica clasică este genetica mendeliană sau conceptul mai vechi de genetică, care se exprima exclusiv pe baza fenotipurilor rezultate din experimentele de reproducere, în timp ce genetica modernă este noul concept de genetică, care permite investigarea genotipurilor împreună cu fenotipurile.
Marele om de știință Gregor Mendel este tatăl geneticii. Mendel a introdus mai multe legi privind moștenirea trăsăturilor și modul în care trăsăturile trec de la părinte la descendenți. Astfel, descoperirile sale au devenit baza noului concept descoperit mai târziu în genetică. Prin urmare, genetica clasică și genetica modernă sunt două concepte distincte. Cu toate acestea, genetica clasică este baza geneticii moderne.