Diferența cheie între protostomi și deuterostomi este că în protostomi blastoporul devine gură, în timp ce în deuterostomi devine anusul. O altă diferență majoră este că embrionii protostomilor suferă clivaj spiralat, în timp ce embrionii deuterostomilor suferă clivaj radial.
Înțelegând acești doi termeni, ar fi important să fim atenți la modul în care are loc dezvoltarea embrionară a organismelor. Ar fi deosebit de important să se ia în considerare animalele cu celom, care este o cavitate plină de lichid situată între endoderm (intestin) și mezoderm (în principal stratul muscular); cu alte cuvinte, celomul este peritoneul la mamifere. Protostomii și deuterostomii sunt cele două tipuri principale de animale celomate și există multe diferențe între ele. În primul rând, diferă prin modul în care gura și anusul lor sunt formate în timpul dezvoltărilor embrionare.
