Diferența cheie între cristalografia cu raze X și RM este că RMN este o tehnică analitică utilizată pentru a determina tipul și numărul atomilor dintr-o moleculă organică, în timp ce cristalografia cu raze X este o tehnică analitică utilizată pentru a determina structura atomică și moleculară a unui cristal..
Termenul RMN înseamnă rezonanță magnetică nucleară. Acest termen intră sub spectroscopia subtopic în chimia analitică. Cristalografia cu raze X, pe de altă parte, este un tip de tehnică cristalografică în care folosim un fascicul de raze X pentru analiza cristalelor.