Diferența cheie între CDS și ADNc este că CDS sau secvența de codificare este partea unui transcript care este de fapt tradus în proteină în timp ce secvența ADNc este o secvență de ADN derivată din ARNm prin transcriere inversă.
O genă este o secvență de nucleotide care codifică o proteină. Se compune din diferite regiuni ca regiune promotor, site de inițiere a transcripției, exoni, codon de pornire, introni și codon de oprire. Prin urmare, o genă are atât secvențe codante, cât și secvențe necodificate. Secvențele de codare sau CDS se referă la exoni și doi codoni, care sunt codon de pornire și codon de oprire. Este secvența care se traduce de fapt într-o proteină. În contrast, ADNc este o secvență de ADN derivată din ARNm prin transcriere inversă.
