Diferența cheie între introni și exoni este că intronii sunt secvențe necodificatoare ale unei gene, în timp ce exonii sunt secvențe codificatoare. Prin urmare, intronii nu apar în moleculele de ARNm mature, în timp ce exonii formează colectiv molecula de ARN final.
Intronii și exonii sunt termeni folosiți frecvent în domeniul biologiei moleculare, dar când cineva începe să se familiarizeze cu acești termeni, ar apărea confuzie, deoarece ambii sunt secvențe de nucleotide ale genelor.