Diferența cheie între fisiunea multiplă și fragmentarea este că fisiunea multiplă este un tip de fisiune în care nucleul părinte se împarte de mai multe ori mitotic, producând mai multe celule fiice noi, în timp ce fragmentarea este un tip de reproducere asexuată în care organismul părinte tocmai se rupe în mai multe fragmente care sunt capabile să crească în indivizi noi.
Există două tipuri de reproducere ca reproducere asexuată și reproducere sexuală. Reproducerea asexuală are loc de la un singur părinte. Nu implică gamete masculine sau feminine. Mai mult, există diferite tipuri de metode de reproducere asexuată. Unele dintre acestea includ fisiunea (fisiunea binară și fisiunea multiplă), fragmentarea, regenerarea, înmugurirea, formarea sporilor. Cu toate acestea, acest articol se concentrează în principal pe diferența dintre fisiunea multiplă și fragmentarea.