Diferența cheie între structurile iso și neo este că prefixul iso se referă la un compus organic care conține toți atomii de carbon, cu excepția unuia care formează un lanț continuu, în timp ce prefixul neo se referă la un compus organic care conține toți atomii de carbon, cu excepția a doi care formează un lanț continuu.
Folosim prefixe în chimia organică pentru a distinge o moleculă organică de alta. Folosim aceste prefixe împreună cu numele compusului. Deoarece aceste prefixe sunt specifice pentru diferite grupuri funcționale din moleculele organice, putem identifica cu ușurință moleculele organice, chiar dacă acestea au structuri chimice strâns legate.