Diferența cheie - Exome vs Transcriptome
O genă conține regiuni de codificare și necodificare în cadrul acesteia. Secvențele de codificare sunt cunoscute sub numele de exoni, iar secvențele necodificate sunt cunoscute sub numele de introni. Secvența nucleotidică a exonilor unei gene reprezintă codul genetic al genei pentru a sintetiza proteina specifică. Prin urmare, exonii rămân în molecula de ARNm. Regiunea totală a exonului genomului este cunoscută sub numele de exom și este o parte importantă a genomului. Codul genetic al genelor este convertit în codul genetic al moleculei de ARNm, care este necesar pentru producerea de proteine. Întreaga moleculă de ARNm transcrisă într-o celulă sau o populație de celule la un moment dat este cunoscută sub numele de transcriptom. Diferența cheie între exom și transcriptom este că exomul reprezintă secvențele regiunilor exonice ale genomului, în timp ce transcriptomul reprezintă ARNm total al unei celule sau al unui țesut la un moment dat.
CUPRINS
1. Prezentare generală și diferența cheie
2. Ce este Exome
3. Ce este Transcriptomul
4. Comparație Side by Side - Exome vs Transcriptom
5. Rezumat
Ce este Exome?
Genele sunt compuse din exoni, introni și secvențe reglatoare. Exonii sunt regiunile genice care sunt transcrise în secvența ARNm în timpul transcrierii. Intronii și alte regiuni necodificate sunt eliminate în timpul transcrierii. Secvența nucleotidică a exonilor determină codul genetic al genei care sintetizează proteinele specifice pe care le codifică. Doar exonii rămân în ARNm al unei proteine. Colecția de exoni din genom este cunoscută sub numele de exom al unui organism. Reprezintă o parte a genomului care este exprimată în gene. La om, exomul reprezintă 1% din genom. Este porțiunea care codifică proteinele din genomul uman.
Figura 01: Exome
Ce este Transcriptomul?
Transcriptomul este colecția tuturor transcrierilor (ARN) care codifică proteinele și necodifică într-un țesut dat. Transcriptomul reprezintă colecția de molecule totale de ARNm exprimate de gene într-o celulă sau un țesut. Transcriptomul unei celule poate fi variat cu transcriptomul unui alt tip de celulă. Transcriptomul este, de asemenea, dinamic - se schimbă în timp, ca răspuns la stimulii interni și externi. Chiar și în același țesut sau în același tip de celulă, transcriptomul se poate schimba după câteva minute.
Transcriptomul diferă de exomul unui organism. Transcriptomul include numai secvențele exome exprimate. Deși exomul unei celule rămâne același, transcriptomul diferă între celule, deoarece expresia genică nu este aceeași pentru toate celulele sau țesuturile. Numai genele esențiale sunt exprimate în diferite celule și țesuturi. Expresia genică este un proces specific de tip tisular sau celular. Este reglementat de diverși factori, inclusiv factori de mediu. Prin urmare, transcriptomul poate varia în funcție de condițiile de mediu externe.
Transcriptomul este utilizat ca precursor pentru studiile de proteomică. Toate proteinele sunt derivate din secvențe de ARNm. Modificările translaționale pot duce la modificări ale proteinelor. Cu toate acestea, transcriptomul oferă informații de bază importante pentru studiile proteomice.
Figura 02: Transcriptomul celulelor stem embrionare
Care este diferența dintre Exome și Transcriptome?
Difuzarea articolului din mijloc înainte de tabel
Exome vs Transcriptome |
|
| Exomul este colecția de regiuni care codifică proteinele genelor. | Transcriptomul este colecția tuturor ARN-urilor transcrise, inclusiv ARNm. |
| Probă | |
| Exomul este studiat folosind probă de ADN. | Transcriptomul este studiat folosind o probă de ARN. |
| Metoda de studiu | |
| Secvențierea întregului exom este metoda studierii exomului. | Secvențierea ARN este metoda de studiu a transcriptomului. |
Rezumat - Exome vs Transcriptome
Exonii sunt secvențele codatoare ale genelor și determină secvențele ARNm ale proteinelor. Colecția acestor secvențe de codificare (exoni) este cunoscută sub numele de exome ale unui organism. Genele sunt transcrise în molecule de ARNm înainte de a produce proteine. Moleculele totale de ARNm ale unei celule sau ale unui țesut la un moment dat sunt cunoscute ca transcriptom. Transcriptomul reprezintă genele care sunt exprimate activ în ARNm la un moment dat. Transcriptomul este specific celulelor și țesuturilor și afectează condițiile de mediu. Aceasta este diferența dintre exome și transcriptom.
