Transposon vs Retrotransposon
Transpozonii și retrotransponienii sunt componente genetice ale ADN-ului și există diferențe majore între ele. Prezența procentuală a acestor materiale genetice variază în funcție de specie, iar funcțiile lor determină soarta organismului cu mutații și alte modificări importante din punct de vedere fenotipic. Transpozonii și retrotranspozonii sunt gene sau colecții ale anumitor gene localizate în firele ADN, iar modificările locațiilor lor au fost principalele cauze ale acestor consecințe. Cu toate acestea, acest articol intenționează să discute pe scurt funcțiile acestor gene și prezintă o comparație între transpozoni și retrotranspozoni.
Ce este Transposon?
Transpozonii sunt fragmente sau segmente interesante de ADN cu capacitatea de a schimba locația firului de ADN sub formă de mecanism de tăiere și lipire. Datorită acestei caracteristici mobile a transpozonilor, acestea sunt cunoscute sub numele de gene săritoare. Transpozonii sunt de două tipuri majore cunoscute sub numele de Transpozoni Clasa I și Transpozoni Clasa II. De obicei, tipul clasei II este denumit transposoni, iar tipul clasei I este denumit retrotransposoni. Procesele de tăiere și lipire a segmentelor mobile de ADN sunt reglementate de enzima transposază. Enzima se leagă de ambele capete ale transposonului și taie legăturile fosfodiesterice ale catenei ADN, izolează transposonul, îl mută la locul țintă și se leagă în noua locație. Cu toate acestea, acest proces este interesant de înțeles,deoarece unii transpozoni se pot muta în anumite locații numai din cauza incompatibilității secvențelor de bază cu site-ul țintă. Genele cu un capăt al unei singure catene au aceeași secvență de bază cu celălalt capăt al celeilalte catene sunt transpozoni cu margini lipicioase, deoarece acestea se pot lega de situsurile catenei de ADN țintă cu aceeași secvență de bază ca în capetele lipicioase. Cu toate acestea, această mobilitate a genelor poate provoca modificări ale genotipului, precum și ale fenotipului organismului. Oamenii de știință au inventat despre transpozoni și despre alimentele și organismele modificate genetic, în conformitate cu personalizările preferate, apoi au fost puse la dispoziție. Culturi agricole foarte productive, antibiotice cu proprietăți medicinale,animalele pentru animale au fost unele dintre produsele dezvoltate în mod avantajos după invenția transpozonilor de către Barbara McClintock în anii 1940.
Ce este Retrotransposon?
Retrotranspozonii sunt transpozonii de clasa I, iar aceștia se mișcă prin genom prin mecanismul de copiere și lipire. Mecanismul mobilității retrotranspozonilor implică câțiva pași majori, cum ar fi copierea segmentului genetic al catenei ADN în ARN, transferul copiei ARN la locul țintă, transcrierea secvenței ARN înapoi în ADN utilizând transcriptaza inversă și inserția a genei în noua locație a catenei de ADN a genomului. Cele două capete ale acestor retrotranspozoni au de obicei repetări terminale lungi cu aproximativ 1000 de perechi de baze, iar acestea sunt utilizate ca trăsături de identificare a acestor gene. Aceste gene sunt ușor de amplificat în interiorul genomului, iar procentul de retrotranspozoni din genomul uman este de aproximativ 50%. Acestea ar putea fi destul de periculoase ca virusul cauzal al SIDA, HIV,și virusul leucemiei cu celule T au retrotranspozoni în genomul lor de ARN. De fapt, acești viruși pot lega retrotranspozonii în orice situs al firelor de ADN uman cu utilizarea transcriptazei inverse și a integrazei. Enzima integrază funcționează la fel ca transpozaza în transpozonii de clasa II.
Care este diferența dintre Transposon și Retrotransposon?
• Transpozonii sunt gene săritoare de clasa II, în timp ce retrotranspozonii se încadrează în categoria clasei I.
• Transpozonii funcționează cu enzima transposazică, în timp ce retrotranspozonii funcționează cu utilizarea a două enzime principale cunoscute sub numele de transcriptază inversă și integrază.
• Capetele terminale sunt mult mai lungi în retrotranspozoni decât în transpozoni.
• Transpozonii sunt tăiați de la origine și lipiți la țintă; invers, retrotranspozițiile fiind copiate de la origine în ARN și transcrise la țintă.
• Mișcarea retrotranspozonilor implică ARN, dar nu și în transpozoni.
