Diferența cheie între cilia stereocilia și microvili este că cilii sunt mici structuri asemănătoare părului compuse din microtubuli, în timp ce stereocilii sunt mănunchiuri de proiecții asemănătoare părului compuse din filamente de actină, iar microviliții sunt pliuri ale membranelor celulare compuse din filamente de actină.
Cili, stereocili și microvili pot apărea ca structuri similare atunci când sunt observate din exterior. Dar ele sunt structural și funcțional diferite între ele. Sunt structuri asemănătoare părului, care sunt microscopice. Mai mult, acestea sunt fibre proteice care se extind în afară de celule.