Diferența cheie între specificitatea substratului și specificitatea legăturii este că specificitatea substratului este capacitatea unei enzime de a alege substratul exact cu care se poate lega dintr-un grup de compuși similari, în timp ce specificitatea legăturii este capacitatea unei enzime de a alege substraturi cu legături similare și structuri similare.
Termenii specificitate substrat și specificitate legătură intră în domeniul biochimiei, în ceea ce privește activitatea enzimelor. Putem defini o enzimă ca un catalizator biologic. Asta înseamnă că enzimele sunt compuși care pot spori rata funcțiilor biologice care au loc în celule, dar nu sunt consumate în timpul funcției. Termenul de specificitate se referă la modul în care o anumită enzimă se leagă de un anumit substrat.