Diferența cheie între legătura genetică și dezechilibrul legăturii este că legătura genetică este tendința a două sau mai multe gene ale aceluiași cromozom de a rămâne împreună în procesul de moștenire, în timp ce dezechilibrul legăturii este asocierea non-aleatorie a alelelor la loci diferiți dintr-o populație..
Legătura genetică și dezechilibrul legăturii sunt două concepte în genetică care urmează moștenirea non-mendeliană. Legătura genetică se referă la starea fizică de a fi legat într-un cromozom. În cuvinte simple, este procesul în care genele sunt strâns situate într-un cromozom, astfel încât acestea să fie întotdeauna moștenite împreună în gameți. Pe de altă parte, în genetica populației, dezechilibrul legăturii se referă la asocierea non-aleatorie a alelelor la loci diferiți dintr-o populație. Este măsura diferenței dintre frecvența observată a unei anumite combinații de alele la doi loci și frecvența așteptată pentru asocierea aleatorie.