Diferența cheie dintre bacterioclorofilă și clorofilă este că fototrofele anoxigenice, cum ar fi bacteriile purpurii, heliobacteriile și bacteriile cu sulf verde, etc. au bacterioclorofile, în timp ce fototrofele oxigenice, cum ar fi plantele verzi, algele și cianobacteriile, au clorofile.
Există două tipuri de fotosinteză; fotosinteza oxigenică și fotosinteza anoxigenică. Există, de asemenea, două tipuri de pigmenți fotosintetici precum clorofila și bacterioclorofila. Fototrofele oxigenate au clorofilă, în timp ce fototrofele anoxigenice au bacterioclorofilă. Bacterioclorofila și clorofila sunt similare în structura generală. Dar diferă prin substituțiile din jurul inelului și prin lungimea și substituțiile de pe coada de fitol. Există patru tipuri de clorofile, în timp ce există șapte tipuri de bacterioclorofile.
