Diferența cheie între efectul izotop cinetic primar și secundar este că efectul izotop primar descrie substituția izotopică la legătura ruptă, în timp ce efectul izotop secundar descrie substituția izotopică la legătura adiacentă legăturii rupte.
Efectul izotopului cinetic sau KIE se referă la modificarea vitezei de reacție a unei reacții chimice la înlocuirea unui izotop. Aici, un atom dintr-un reactant este înlocuit de izotopul său, astfel încât viteza de reacție ar fi diferită de viteza inițială. Apoi putem determina o valoare pentru KIE prin divizarea constantei vitezei pentru reacția care implică reactantul ușor substituit izotopic de la constanta vitezei pentru reacția care implică reactantul greu substituit izotopic. Prin urmare, KIE mai mare de 1 este considerat ca efect izotopic cinetic normal, în timp ce KIE mai mic de 1 este considerat ca efect isotopic cinetic invers.