Diferența cheie între transformare și transducție este că transformarea este un mecanism care modifică materialul genetic al bacteriilor prin absorbția directă a materialului genetic exogen din mediul înconjurător prin membrana celulară și încorporarea acestuia în genom, în timp ce transducția este injectarea de ADN străin de către un virus bacteriofag în bacteria gazdă.
Conjugarea este o metodă binecunoscută de recombinare a ADN-ului, care poate fi găsită atât în eucariote, cât și în procariote. Oamenii de știință au descoperit că este posibil să se transfere ADN-ul dintr-o celulă bacteriană în alta prin alte două mecanisme: transformare și transducție. Similar cu conjugarea, aceste două mecanisme transferă ADN într-o singură direcție, iar recombinarea are loc între alele în regiunile ADN omoloage. Ambele mecanisme transferă foarte puține cantități de ADN și nu transferă întregul cromozom celular.