Diferența cheie între moleculă și atom este că molecula este o combinație de doi sau mai mulți atomi prin legături chimice, în timp ce atomul este o specie chimică individuală care se poate combina între ele pentru a forma molecule și ioni.
Toată materia din lume este alcătuită din atomi și molecule, prin urmare le putem considera drept elementele constitutive ale tuturor lucrurilor de pe această planetă, inclusiv de noi. În termeni laici, putem spune că cea mai de bază și, de asemenea, cea mai mică unitate a oricărui element chimic este un atom. Un element chimic este o specie de atomi. De exemplu, cea mai mică unitate de oxigen gazos este atomul de oxigen; îl putem reprezenta prin litera O. Cu toate acestea, acest atom de oxigen nu există independent și numai atunci când se combină chimic cu un alt atom de oxigen devine stabil. Apoi devine o moleculă și o putem reprezenta prin formula chimică O 2.