Diferența esențială dintre rezonanță și efectul mezomeric este că rezonanța este rezultatul interacțiunii dintre perechile de electroni solitari și perechile de electroni legați, în timp ce efectul mezomeric rezultă din prezența grupurilor substituente sau a grupurilor funcționale.
Cele două concepte chimice de rezonanță și efect mezomeric determină structura chimică exactă a unei molecule organice. Rezonanța apare în molecule având perechi de electroni singulari pe oricare dintre atomii din moleculă. Efectul mezomeric apare dacă o moleculă are substituenți sau grupări funcționale. Ambele fenomene sunt comune în moleculele organice.
