Diferența esențială dintre mastigomicotină și zigomicotă este că mastigomicotina este un grup polifiletic de ciuperci care produc celule flagelate și au rizoizi, în timp ce zigomicota este o diviziune a ciupercilor care produc spori sferici caracteristici rezistenți numiți zigospori în timpul reproducerii sexuale.
Ciupercile sunt organisme eucariote filamentoase aparținând Ciupercilor Regatului. Ele produc atât spori sexuali, cât și spori asexuali. Pot fi saprofite sau paraziți. Există diferite tipuri de grupe fungice. Grupurile majore sunt mastigomicotina, zigomicota, ascomicota, basidiomicota și deuteromicota. Mastigomicotina este formată din ciuperci zoosporice în care multe sunt doar acvatice. Ciupercile Zygomycota sunt ciuperci conjugative care produc zigospori caracteristici. Ciupercile Ascomycota sunt ciuperci sac care produc o structură asemănătoare sacului numită ascus. Ciupercile Basidiomycota produc o structură în formă de club numită basidium. Ciupercile deuteromicote sunt ciuperci imperfecte, ceea ce înseamnă că au doar starea asexuată sau micelială.
