Diferența cheie între harta genetică și harta fizică constă în tehnicile utilizate în cartarea genomului. La generarea unei hărți genetice, markerii genetici și loci genetici sunt utilizați pentru a studia tiparele de legătură genetică, în timp ce cartografierea fizică utilizează tehnici de biologie moleculară, cum ar fi Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) și tehnici de hibridizare.
Hărți genetice și hărți fizice două tipuri de hărți care construiesc pentru a arăta genele situate în cromozomi. Acestea se implică în diagnosticarea genetică și în prezicerea evoluției în ceea ce privește analiza genomului. Mai mult, aceștia folosesc pentru a analiza distanțele dintre loci genetici și pentru a analiza polimorfismele genetice.
