Diferența cheie între pătratul Punnett și pedigree este că pătratul Punnett afișează toate genotipurile posibile care pot fi moștenite din două genotipuri parentale, în timp ce pedigree reprezintă istoria familială a unei anumite trăsături, în special moștenirea unei gene.
Pătratul Punnett și pedigree sunt două tipuri de instrumente care ajută la determinarea probabilității de moștenire a genelor. Ambele arată probabilitatea de a moșteni o trăsătură anume descendenților. Cu alte cuvinte, ambele prezic modele de moștenire în liniile familiale. Prin urmare, ele pot ajuta la determinarea riscului unei boli moștenite la un copil. Pătratul Punnett este pur și simplu un mod grafic de a arăta toate genotipurile posibile care pot apărea la copiii celor doi părinți.